蛋白质组学范文篇1

【中国分类号】R245【文献标识码】A【文章编号】1044-5511（2011）11-0009-01

针灸血清的概念来源于20世纪80年代的“血清药理学”和90年代的“中药血清”研究。针灸血清的概念于1996年公开提出。1998年杨永清研究员的针灸血清研究获得国家自然科学基金资助。目前已成为针灸研究的一个新亮点［1］。

1.针灸血清

“针灸血清”研究，是指将针灸处理后的人或动物体中采集到的血清，作为效应物质加到另外一个反应系统中，与在体或离体器官、组织、细胞或分子等靶目标接触，通过它们的形态学或功能的改变，直接观察针灸处理后产生的效应［2］，是近年来针灸领域中提出的一种新的研究思路和方法，目前已广泛应用在哮喘、肿瘤、心肌缺血、脊髓损伤等疾病的研究中，实现了针灸离体实验方法学的改进，为针灸研究开辟了一条新的道路。

2.蛋白质组学

蛋白质组学的研究目前已经成为当今生命科学的热点之一。蛋白质作为生命活动的主要承担者，在机体生理功能中发挥着重要作用，一直以来也是研究的重点。其概念最早是由澳大利亚（1994）Wilkins和Willias提出。蛋白质组学是在特定细胞或组织水平上对蛋白质的表达进行研究，具体说它是对不同空间和时间上发挥功能性特定蛋白质群组进行研究，即在蛋白质水平上探索其作用模式、功能机理、调节调控，以及蛋白质群组内相互作用，运用这项技术可以在正常与病理情况下检测蛋白质的差异表达。运用蛋白质组学技术在临床方面可以研究特定蛋白与疾病的关系，从而找到疾病标记蛋白，为疾病诊断、病理分析、药物筛选、新药开发等，提供理论依据［3］。

3.血清蛋白质组学

血清中含有90-91%的水，6.5-8.5%的蛋白质和2%作用的低分子量蛋白质。血清中广泛存在的蛋白质种类大约有10000种，大多数蛋白的含量非常低，即低丰度蛋白。而低丰度蛋白的识别非常重要，潜在的新的疾病生物标志分子往往呈现低丰度。并且许多低丰度蛋白常常行使着“信使”的作用。由于血清蛋白组成极为复杂，因此血清蛋白质组学的关键在于能否将所研究的血清样本进行有效地分离。血清蛋白质组学是指研究选定的目标人群血清中所表达的全部蛋白质，在建立正常蛋白质表达图谱的基础上，寻找差异蛋白质点,鉴定疾病相关蛋白质，进而研究其功能和结构，为研究重大疾病病理生理学机制、早期诊断的特异性标志物、药物作用靶点等开辟新的途径。

4.血清蛋白质组学技术

（1）双向聚丙烯酰胺凝胶电泳（two-dimensionalpolyacrylamidegelelectro-phoresis,2D-PAGE）：双向电泳是一种方便、灵敏的蛋白质分离方法。双向电泳的第一向是等电聚焦，根据蛋白质等电点不同将其分离。双向电泳的第二向是SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳（sodiumdodecylsulfate-polyacry-lamidegelelectrohoresis,SDS-PAGE）［4］：根据蛋白质分子质量不同进一步分离等点相同的蛋白质。双向电泳技术因其分辨率高、可重复性好、结果直观、实验成本较低等特点，已成为蛋白质组研究中最常用的分离技术。另外固定化PH梯度技术可以把目的蛋白固定在极狭窄的凝胶区域加以分离，提高2D-PAGE的重复性与上样量。虽然2D-PAGE分辨率很高，但不能被用于分析低含量蛋白质，灵敏度低，这又与生物体内蛋白质种类数目繁多相比，远不能满足需要，因而容易阻碍早期状态疾病特异性标志物的发现。

（2）质谱技术(mass-spectrometry,MS)MS技术的应用是蛋白质组学研究中的重大进展，它具有高通量、准确、灵敏和操作自动化等优点，已取代传统的Edman降解测序和氨基酸组成分析，成为蛋白质鉴定的核心技术。MS技术根据电离源的不同分为2种：1种是基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorption/ionization-timeofflightmassspectrometry，MALDI-TOF-MS)，其原理是利用氮源脉冲激光使基质吸收激光的能量使固相的多肽样品离子化，离子化的肽段进入质量分析器，因质量/电荷比(m/z)差异发生电离，通过测量肽段离子的相关参数，可获得肽质量指纹(peptidemassfinger-printPMF)、肽序列标签(peptidesequencetag,PST)或部分氨基酸序列,然后用相应的软件寻找蛋白质组数据库，实现对蛋白质的定性鉴定或定量分析。Baumann等［5］通过一系列试验试图使血清蛋白质组学MALDI-TOF-MS技术标准化，并认为单纯解冻的血清标本重复性最好,通过标准化的血清标本预处理、储存程序和磁珠分馏法，可有效提高MALDI-TOF-MS技术的重复性。第2种是电喷雾电离串联质谱(electrosprayionizationtendemmassspectrometry,ESI-MS/MS)，ESI技术是在强电场存在的前提下，在喷射过程中利用电场使液相的多肽样品离子化，产生单价或多价的气态离子，离子化的肽段进入质量分析器而测定其相关参数。ESI的优点在于其可方便地与其它蛋白质分离技术联合应用,如液相色谱+电喷雾+串联质谱(LC-ESI-MS/MS)。串联质谱的可靠性要明显优于MALDI-TOF-MS，现在新建的质谱鉴定实验室多为串联质谱。

（3）表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱(surfaceenchancedlaserdesorptionandionization-timeofflightmassspectrometry,SELDI-TOF-MS)：SELDI是一种以亲和力为基础的质谱法，蛋白质被选择性地吸附到经化学变性的固体表面上，杂质可通过清洗去除。采用能量吸收基质，蛋白质通过激光解吸质谱分析进行识别。SELDI-TOF-MS有许多优点，可以为分子量在200~500kD的蛋白质提供很好的质谱，对一个样本的分析在几十分钟就可以完成，对低丰度蛋白,即使浓度仅atto-mole(10-18)的分子，只要与表面探针结合，就可以检测到。SELDI可直接使用粗样本，即未经处理的原始样本进行检测；可以大规模、高通量、超微量、全自动筛选蛋白质；另外，它不仅可发现一种蛋白质或生物标记分子，而且还可以发现不同的多种方式的组合蛋白质谱，可进行相关疾病的研究。目前SELDI-TOF-MS已经广泛应用于血清蛋白质组学的研究。随着科学技术的发展，应用单一技术平台分离血清样品已经不能满足科研的需要。目前通常采用的方法是联合使用几种不同的技术平台以达到对样品的有效分离。如高丰度蛋白去除+全蛋白酶解+二维液相色谱(阳离子/阴离子交换色谱+反相色谱)分离+质谱鉴定(离子阱或Q-TOF串联质谱)；高丰度蛋白去除+色谱分离+2-DE+联合质谱鉴定等。

（4）蛋白质芯片蛋白质芯片又称蛋白质微阵列，是继基因芯片之后作为基因芯片的补充而发展起来的蛋白质分析技术。它以蛋白质或多肽为材料，可以在同一时相分析整个蛋白质组。根据芯片表面的不同化学成分，可将蛋白质芯片分为化学表面芯片（亲水、疏水、阳离子、阴离子和金属离子整合芯片）和生物表面芯片（抗原抗体、受体配体和DNA蛋白质芯片等）。化学表面芯片用于检测未知蛋白，并获取指纹图谱；生物表面芯片可显示与之结合的抗原或配体的不同分子量亚型。目前常将蛋白在芯片、SELDI相结合来研究差异表达蛋白质，即不同的蛋白质样品和同一种蛋白质芯片相作用，洗掉未结合的蛋白质，然后用SELDI进行分析鉴定。它可用于对血清及组织样品中的各种蛋白质直接进行检测，特别适于以往蛋白质分析的盲区，即对低分子量、低丰度和疏水的蛋白质进行研究。因此，在蛋白质组学的研究中与目前常规方法相比具有较显著的优势。

5.展望

近年来针灸血清的研究成为一大亮点，研究者认为针灸血清中含有某些活性物质，从而发挥治疗和预防疾病的作用。目前对针灸血清成份的研究，虽取得了一定成果，但尚未完全揭示其本质，今后应进一步结合蛋白质组学技术，进行针灸血清的研究。在针灸血清种类研究方面，目前主要集中在针刺血清，电针血清，艾灸血清和天灸血清，其它报道较少，今后可以结合更多的特色针灸方法，对其血清进行相关研究［6］。如对自血穴位注射等具有特色疗法的针灸血清进行深入、系统研究，对于揭示针灸血清的作用机理，可能具有突破性意义。对于针灸血清的作用机理，当前学者多结合具体病种，从细胞水平或信号转导途径等进行研究，针灸血清可能通过多靶点，多途径发挥作用，今后研究角度应进一步深入。

参考文献

［1］杨永清，陈汉平，王宇，等。针灸效应物质基础研究。针刺研究，2007，32（12）：399-401

［2］王宇，杨永清，陈汉平，等。“针灸血清”研究进展。上海针灸杂志，2007，26（1）：12-15

［3］PAGEMJ,GRIFFITHSTAM,BLEACKLEYMR,etal.Proteomicsapplicationsrelevanttotransfusionmedicion.TransMedRev,2006,20:63-74

［4］WuW,TangX,HuW,etal.Identificationandvalidationofmetastasis-associatedproteinsinheadandneckcancercelllineslinesbytwo-dimensionalelectrophoresisandmassspectrometry.ClinExpMetastasis,2002,19(4):319-326

［5］BaumannS,CeglarekU,FiedlerGM,eta.lStardardizedapproachtoproteomeprofilingofhumanserumbasedonmagneticbeadseparationandmatrix-assistedlaserdesorption/ionizationtime-of-flightmassspectrometry［J］.ClinChem,2005,51(6):973-980

蛋白质组学范文

【关键词】低剂量辐射二维凝胶电泳质谱

serumproteomeinmiceafterlowdoseradiation

liwei，zhangyi?qiong，wangguan?jun,wangjie1,zhangxue?min1

deptartmentofhematologyandonocology,thefirstclinicalhospitalofjilinuniversity,changchun130021china;1nationalcenterofbiomedicalanalysis,beijing100850,china

abstractthisstudywaspurposedtoinvestigatethemechanismoflowdoseradiation(ldr)byproteomictechnologyandtofindthekeyproteinsofthehormesisandadaptiveresponseinducedldr,whichprovidedthefoundationofexperimentalandtheoreticalbasisfortheclinicalapplicationofldr.two?dimensionalelectrophoresis(2?de)wasusedtoscreenproteinpatternsofnormalserumandserumofmiceexposedtoldrindifferenttimeforqualitativeandquantitativedifferencesinproteinexpression.andthedifferentially?expressedproteinsbetweenthetwogroupswereidentifiedbymatrixassistedlaserdesorption/ionization?timeofflight?massspectrometry(maldi?tof?ms).theresultshowedthatamongthedifferentially?expressedproteinsbetweenthegroupexposedtoldrandthecontrolgroup(shom?irradiatedgroup),itwasfoundthatafterldrnew4proteinsappeared,13proteinswereup?regulated,6proteinsweredown?regulated,3proteinsdisappearedinthegroupexposedtoldr.indifferenttimethequantityofsomeproteinswasdifferent,theproteinexpressionhadsomecharacteristics,theestrogenreceptor2wasdown?regulated,thevitamind?bindingproteinandapolipoprotienwereup?regulatedinthegroupexposedtoldr.itisconcludedthatldrup?regulateordown?regulatesomeproteins,someproteinsrelatedwithldrwerefound.itmayprovidesomenewexplanationsfortheeffectmechanismoftheldr.

keywordsproteome；lowdoseradiation；two?dimensionalelectrophoresis；massspectrum

jexphematol2007;15(1):191-194

近十几年来，低剂量辐射的生物学效应的发现具有重要的实际意义，人们将其生物学效应分为两大类，一是兴奋效应，二是适应效应。然而，目前对其作用机制尚不十分清楚。已有人证明，低剂量辐射后，松果体及免疫细胞的某些膜抗原、信号蛋白、周期蛋白等发生变化，继而间接或直接地产生免疫刺激作用［1-3］，但是，国内外有关低剂量辐射对造血系统作用机制的研究报道还很少。随着蛋白质组学研究的兴起及其研究技术的开发和完善，从细胞蛋白质总体水平研究生命的活动规律已成为可能，蛋白质是生命功能的直接载体，蛋白质翻译后加工对功能的影响意义重大，而该领域的研究为基因组所不及。因此，用蛋白质组学方法对低剂量照射组及假照组的血清蛋白质表达差异进行分析，有利于发现与低剂量辐射作用机制有关的蛋白，从细胞整体水平上动态地研究低剂量辐射对造血系统的作用机制，为低剂量辐射的临床应用提供实验依据和理论基础。

材料和方法

昆明雄性小鼠体重（20±2）g，均购自本校动物部。共120只，随机分为两组：每组60只，一组为假照射组，另一组给予75mgy的x线照射，分别于照射后24、48、72小时处死。每个时间点分别处死照射组小鼠20只，对照组小鼠20只。

照射条件

深部x线发生机,电压200kv,电流10ma,滤板0.5mmcu+1.0mmal,全身照射,靶源与皮肤距离212cm,剂量率12.5mgy/min。

样品的制备

在处死小鼠前，每只小鼠给予腹腔注射2.5ml肝素，2分钟后进行眼球后动脉取血。将血浆436×g离心，取上清，去掉红细胞，再经2280×g转高速离心取上清，基本去掉血小板。每组将20只小鼠的血清混合，用bradford法定量后按一次银染或考马斯亮蓝染色的量分装，-70℃保存备用。

双向凝胶电泳

用双向凝胶电泳（2?de）［4］方法进行细胞蛋白质的分离，利用银染和考马斯亮蓝染色方法进行电泳凝胶染色。

凝胶图像采集与分析

染色后的双向电泳凝胶用凝胶图象扫描仪（amershampharmaciabiotech）扫描。数字化图像文件采用nonlineardynamics公司的二维电泳处理软件（imagemastertm2delite5.0）分析，获得每个蛋白点的分子量（mr）、等电点（pi）及相对含量。

差异表达点的质谱鉴定

加大双向电泳中的蛋白上样量（1mg），用考马斯亮蓝染色方法进行染色，找到对应的差异点，切出蛋白点后进行脱色、胶内胰酶酶切和肽段提取［5］，然后用maldi?tof/ms进行肽质量指纹谱（pmf）分析。检索结果的可靠性用肽段匹配率、得分值（score）和匹配肽段在对应蛋白内的序列覆盖率进行评价。

统计学分析

用newman?keuls方法检验差异蛋白点相对含量的差别是否有统计学意义。

结果

样本的2?de图谱的分析

本研究小鼠的血清，是将20只小鼠的血清混合，基本可以忽略个体差异。经imagemaster2?delite5.0软件及手工分析，每块2?de胶可分离近800个蛋白点左右。每组样本都经过3次以上的重复试验，同一份标本平行电泳的匹配率在95%以上，并且各蛋白点的强度变化无显著性差异，说明本实验条件具有很高的稳定性和重复性。差异表达点标示如图1，假照射组与照射组不同时间点差异表达点在2?de图谱上局部放大图如图2。通过对照射组与假照射组血清双向电泳图谱比较发现，在照射组新出现的蛋白点有4个，表达上调的蛋白点有13个，表达下调的蛋白点有6个，消失的蛋白点有3个。不同时间的差异表达点详细列于表1，每个差异表达点的等电点和分子量列表见表2，某些差异表达点在不同时间点表达量呈现动态的变化，图3为差异蛋白点随时间变化的半定量曲线，%vol代表蛋白点的相对体积，%vol=（vol/∑ns=1vols）×100，vols是在包含n个蛋白点的一张凝胶中蛋白点s的体积。%vol把蛋白质上样和染色引起的变化考虑进去,当%vol比较超过两倍以上认为有统计学意义。如图3所示，11、12号点在24、48、72小时与假照组相比表达均上调，但在48小时表达上调最明显，在72小时蛋白表达量逐渐降低。5号点在照射组48小时表达量最少。

差异表达点的质谱鉴定

鉴定结果表明，大多数蛋白点的出峰情况较好。本研究蛋白点质谱鉴定的详细列表见表3。图4为maldi?tof?ms对5号点质谱分析结果。一些蛋白在2?de上的位置与理论pi和mr不符，或在2?d胶上表现出不同的蛋白点鉴定后为同一蛋白质，这与蛋白质的翻译后修饰有关，如蛋白酶降解、糖基化和磷酸化，目前鉴定出6种差异蛋白质，其中低剂量照射后新出现ttrprotein，一种未命名的蛋白消失，

讨论

目前人们对低剂量辐射的作用机制的研究多集中在对个别或少数蛋白质的作用进行探讨，而低剂量辐射对机体的生物效应表现在多个系统和多个层面，有必要用更高通量的方法全面地分析其发生机制。因此用蛋白质组学方法对低剂量照射组及假照射组的血清蛋白质表达差异进行分析，从细胞整体水平上动态地探讨低剂量辐射对造血系统的作用机制，有利于发现与低剂量辐射的作用机制有关的关键蛋白质，为低剂量辐射作用机制的研究开拓的一个新的研究方法。

通过对照射组与假照射组血清双向电泳图谱比较发现，在照射组新出现的蛋白点有4个，表达上调的蛋白点有13个，表达下调的蛋白点有6个，消失的蛋白点有3个。某些蛋白质点的表达在不同时间呈现动态的变化（如11、12、5号点），这与我们课题组前期工作的结果［6］相一致，低剂量辐射对造血系统的影响在照射后24小时开始出现，在48小时作用最强，在72小时后作用逐渐消失。

本研究发现低剂量辐射后血清中维生素d结合蛋白表达上调，维生素d结合蛋白是核受体超家族的成员［7］，核受体与启动子和增强子上的激素应答元件及其它dna序列特异性激活因子结合，从而激活或阻遏靶基因的转录，特异性调控发育、生殖、代谢相关基因的表达，低剂量辐射后血清中维生素d结合蛋白的表达增加，从而影响了信号的传导、基因的表达，可能产生某些保护性蛋白，而发生生物学效应。此外，低剂量辐射后血清中雌激素受体表达减少，有研究表明，前列腺癌激素治疗中常伴有良性但疼痛的乳腺增生，低剂量辐射可以减少或减轻这种副作用的发生［8］，男性乳腺发育与雌激素有密切的关系［9］，低剂量辐射可能是通过减少雌激素受体的表达来影响雌激素的作用从而产生这一生物学效应。另外，雌激素除调节人体生长发育和生殖外，在心血管、肿瘤、骨代谢等方面还具有广泛的生物学效应［10］。雌激素受体也属于核受体超家族的成员［7］，它能与dna应答元件(dna?responsiveelement)结合的配体激活转录调控因子，最终通过影响转录起始复合物的组装和活性作用来调控靶基因转录。这些可能是低剂量辐射产生多种生物学效应的机制之一。其它差异蛋白的功能涉及细胞代谢、细胞形态维持和信号传导等有待于进一步探讨。

本课题组以往对低剂量辐射引起生物学效应的研究［11,12］也反映了细胞对低剂量辐射反应过程的多样性，它覆盖了细胞周期、信号传导、细胞骨架、代谢、应激反应等重要的细胞生物学过程中的多种蛋白质表达的变化。本研究通过蛋白质组学方法对低剂量辐射后血清蛋白质表达差异进行分析，表明低剂量辐射使细胞某些蛋白表达上调或下调分泌入血清或者直接使血液有形成分的蛋白发生变化，通过这些蛋白质的变化影响各系统功能的改变，产生兴奋效应和适应效应。这为低剂量辐射作用机制的研究提供了一种新的有效的研究手段，从整体水平动态地探讨低剂量辐射的作用机制，进而为低剂量辐射的临床应用提供实验依据和理论基础。

【参考文献】

1傅海清，鞠桂芝等.电离辐射对小鼠胸腺细胞和脾细胞p53基因mrna和蛋白表达的影响.辐射防护，2001，vol21，no.2，89-92

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3孟庆勇，陈沙力，刘树铮等.低剂量辐射诱导小鼠脾细胞蛋白表达及生物活性.中华放射医学与防护杂志，2000；4：228-231

4张群业，黄秋花，沈树红等.人apl细胞株nb4不同二维电泳条件对电泳结果的影响.中国实验血液学杂志,2004;12:401-405

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8dickerap.thesafetyandtolerabilityoflow?doseirradiationforthemanagementofgynaecomastiacausedbyantiandrogenmonotherapy.lancetoncol,2003;4:30-36

9高坤,孙伟.雌激素与肾脏疾病的研究进展.中国中西医结合肾病杂志,2004;5:738-741

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蛋白质组学范文

【关键词】药物研究；蛋白质组学

【中图分类号】R156.3【文献标识码】B【文章编号】1005-0515(2011)12-0379-01

药物研究是一个漫长的过程,基因组技术的发展对药物研究起到了巨大的推动作用,但如何加快药物发现和药物开发的速度,开发有效的药物仍然是药物研究的重点和难点。蛋白质组学作为基因组时代或后基因组时代的核心部分,可以通过直接比较正常体与病变体、给药前后蛋白质图谱的变化弄清疾病的发生发展,发现药物蛋白靶点及药物治疗的分子机制,从而使快速发现更有效的药物成为可能。

1蛋白质组学研究近况

1.1蛋白质组学相关概念：

蛋白质组这一概念是1995年由澳大利亚学者[1]最先提出来的,指的在一个特定的时间和空间内,一个基因组、一种细胞组织或一种生物体所表达的全部蛋白质。对蛋白质组相关问题的研究称之为蛋白质组学,主要是在整体水平上研究细胞内蛋白质的

组成及其活动规律。

1.2蛋白质组学相关技术：

经典的蛋白质组学研究技术主要包括四大方面:(1)蛋白质的分离技术;(2)蛋白质鉴定技术;(3)蛋白质相互作用的研究技术;(4)大量数据的分析技术。其中二维凝胶电泳和质谱技术是蛋白分离纯化鉴定的核心技术。近几年随着蛋白质组学的发展,出现了不少新的研究技术和研究思路,如固相化pH梯度胶条、二维差异凝胶电泳、多维色质联用、表面增强激光解析离子化-蛋白质芯片系统,表面等离子共振、同位素亲和标记等技术的发展,不仅优化了普通二维电泳上样量和检测的极限,而且在自动化、特异性和重复性上都有所突破。

2在药物研究中的应用

近年来,随着蛋白质组学的快速发展,蛋白质组学技术在药物研究领域有着越来越多的应用,为高通量、特异性、快速的进行药物相关研究提供了强有力的技术支持。

2.1靶点的发现和确认：

药物靶点是指药物在体内的作用结合位点,包括基因位点、受体、酶、离子通道、核酸等生物大分子。筛选与确定新的药物作用靶点不仅为揭示药物的作用机理提供了重要信息,而且对新药的开发研制、建立筛选模型、发现先导化合物等也具有重要意义。Weingarten等用二维电泳和生物质谱联用技术,对调节性T细胞进行了蛋白质组学分析,寻找与其功能相关的蛋白靶点,以期找到用于治疗多发性硬化症等免疫系统疾病的新药物靶点。Hu等对法尼基转移酶抑制剂的抗癌作用机制进行了蛋白质组学研究。他们对药物作用前后的卵巢癌细胞总蛋白进行了双向电泳以及质谱分析,发现热休克蛋白70在药物作用后表达上调,然后利用热休克蛋白抑制剂和酶联免疫吸附分析进行了后续研究,他们进一步发现热休克蛋白70能够对法尼基转移酶导致的癌细胞凋亡起到保护作用,而热休克蛋白70的抑制可能成为卵巢癌治疗的新靶点[2]。

2.2耐药相关机制研究中的应用：

在癌症、感染等疾病的治疗中,抗肿瘤、抗菌以及抗病毒等药物的耐药问题已经成为相关疾病难治疗、易复发的主要原因之一。关于耐药机制的探讨已经成为了抗菌药物领域的研究热点。利用该技术,研究人员已经发现了多种与耐药相关的蛋白,如:磷酸丙糖异构酶、HSP27、Sorcin等可能与胃癌多药耐药相关;线粒体转录因子A、组蛋白H2B、组蛋白H4、核糖体蛋白L3等可能与结肠癌5-氟尿嘧啶耐药相关;Sigma调控因子RpoD和膜孔蛋白F可能与铜绿假单胞菌多重耐药相关等。这些蛋白的鉴定为深入研究药物耐药性产生机制提供了线索,而且对进一步筛选具有潜在价值的抗多重耐药的药物治疗靶点具有参考价值。

2.3临床医药研究中的应用：

近年来,蛋白质组学技术也被广泛应用于临床研究中。蛋白质组学技术高通量、大规模的优势在临床药物研究中得以充分发挥。例如:根据不同病理过程中蛋白质的种类和数量的变化,筛选疾病特异性发生变化的蛋白质,把这些特异的与疾病相关的蛋白质作为生物标志物进行疾病筛查和分期、分型;根据不同治疗、用药阶段蛋白质表达发生变化的情况,筛选病程、药物作用相关的蛋白,利用这些蛋白标志物进行病程分析和用药时机的选择等;根据生物标志物在不同疾病中的变化,从而辨别疾病的性质和进程,对预后进行判断等。Eberini等研究了佐剂关节炎大鼠模型服用非甾体类抗炎药前后血清蛋白质表达图谱的变化,发现不同的药物对血清蛋白质表达水平的影响不同,而且血清蛋白表达水平的变化与炎症参数如关节肿胀等平行。此研究表明,通过研究用药前后蛋白质谱的变化可以判断药物的疗效,进而为临床选择用药及观察疗效提供有力依据。

3展望

蛋白质与蛋白质相互作用,交叉形成复杂的网络系统,是各项生命活动的基础。从先导化合物设计、靶点的寻找与确认,到药物疗效和毒性的评价,最终到临床个体化给药的实现,都是蛋白质组学发挥其技术的舞台。蛋白质组学技术为新药研发提供了新的思路,无疑将对药物研究起到强大的推动作用,将有良好的应用前景。

参考文献